这种情况下办理房产证比较麻烦。我国目前房产的所有权转移以过户为准,如你所述,你所购房屋并未办理过户手续,理论上讲,该房在法律上并不属于你。如果原房主为单位,进入破产,那么该房将被列为破产财产,你只对该破产单位享有债权,通过破产程序取得你的债权,而不是房屋的所有权。
目前,你可以通过中介公司,问一下原单位是破产还是改制,有没有承继单位,如果有承继单位,可以通过中介公司和承继单位,(买卖双方一起到房管部门)共同到房管部门办理过户手续,办理产权证。如果没有承继单位,该房产已被列为破产财产进行了分配,你只能通过法律程序、根据你与中介公司的居间合同要求中介公司进行赔偿。或者单位的破产程序正在进行之中,你可以向破产清算组申报你的债权,通过破产程序取得赔偿,不足部分,再根据与中介公司的居间合同,要求中介公司赔偿。